开启精准治疗新篇章——我院内二科开展首例病原体宏基因检测
发布时间:2022-11-07
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作者:内二科
来源:内二科
过去,我院针对重症肺炎、难治性肺炎的诊治主要依靠痰、血、胸水或组织培养、气管镜化验检查辅助诊断以及经验性抗菌药物的使用。这些传统检测方法往往存在病原菌阳性率极度偏低且检测标靶单一、培养所需时间较长、受到抗菌药物影响大、容易漏检、假阴性等等问题。病原菌不明的难治性肺炎容易逐步发展成为“大白肺”、重症肺炎,导致患者出现呼吸衰竭、感染性休克危及患者生命,所以感染病原的探索既是临床医生诊疗过程的中心环节也是难点。

我院内二科在张清主任的带领下,学习氛围热情高涨,职工们积极“啃食”医学诊疗相关的新知识并运用于实践。住院患者赵某某,16岁,因发热、咳嗽1周,在外院治疗后未见好转入我院发热门诊,医师为赵某某检查胸部CT发现:左下肺感染,经排外新冠病毒感染后收住呼吸科。呼吸科主管医师完善痰、血培养等检查后积极予经验性抗感染治疗,但患者经抗感染治疗近5天体温仍在39°C左右波动,并咳嗽剧烈、头痛、不思进食,呕吐明显,一度怀疑是否合并中枢系统感染,予腰椎穿刺检查并送培养。家属十分焦虑,每日不停询问主管医师,让主管医师压力非常巨大,且多次痰、血、脑脊液培养均阴性,无法明确病原体。主管医师结合患者肥胖、既往曾合并糖尿病、抵抗力低,是否合并真菌、结核、病毒等均不能排外,在巨大压力下,只能广覆盖使用抗感染药物。抗感染治疗7天再次复查胸部CT,左下肺感染稍有吸收,但整个左肺均有感染(入科时仅左下肺)。家属质疑、不解。立即予家属沟通气管镜下灌洗液送培养及病原体宏基因测序检测,第二天早宏基因检测结果回报:支原体感染。主管医师蹦着的弦终于松了,家属亦不焦虑了,不需广覆盖使用抗生素了,仅打支原体,后患者好转出院,嘱1月后再复查胸部CT。

此患者入科时及复查胸部CT图片
支原体肺炎的病原体,儿童和青少年多发,突出表现为阵发性刺激性咳嗽,除呼吸系统的表现外,支原体肺炎可伴发皮肤损害,胃肠道、血液系统和中枢神经系统症状,此例患者合并胃肠道、中枢系统症状,为我科总结经验提供很好病例。
本次为我院首例病原体宏基因测序检测,成功找到病原菌,及时予以患者精准治疗,使患者的病痛得到减轻,住院时间明显缩短,医疗费用减少,广谱抗生素使用率及使用强度均明显下降,患者预后更佳。打破了传统经验性抗菌药物使用的枷锁,实现精准抗感染治疗的新突破,开启了我院感染性疾病诊治的新篇章!

病原宏基因组学二代测序
病原宏基因组学二代测序(metagenomics Next Generation Sequencing ,简称mNGS):无需培养,无偏好性,直接提取临床样本中DNA/RNA,采用高通量测序技术,经过数据库比对与生信分析,一次性完成细菌,真菌,病毒和寄生虫等病原体检测。mNGS无需特异性扩增,尤其适用于急危重症和疑难感染的诊断。相对传统病原微生物检测方法,mNGS检测方法具有更快、更准、更全的优势!
内二科气管镜:
我院气管镜于2019年开展,目前拥有奥林巴斯电子支气管镜3条、可移动床旁气管镜2台,其中一名主治医师于华西医院进修气管镜半年、一名主管护师至昆华医院气管镜进修三月。目前我院气管镜开展:支气管镜下钳夹活检术、肺泡灌洗术、细胞刷检术、异物取出术,对危重病人可至床旁吸痰,可气管镜下诱导气管插管。
气管镜刚开展时病例数极少,每年不到100例,随着医务人员对气管镜认识及气管镜对临床的极大帮助,开具气管镜检查的人越来越多,到目前为止,已突破400例每年。为我院呼吸疾病诊断及治疗带来极大福音,气管镜对病因的明确,也进一步提高内二科诊疗水平。


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